Theo kết luận thanh tra, trong giai đoạn 2023–2025, Công ty TNHH D&D đã khấu trừ thuế giá trị gia tăng đối với một số hóa đơn mua ga và bếp ga không phục vụ hoạt động sản xuất, kinh doanh.

Việc này khiến số thuế GTGT doanh nghiệp phải nộp bị thiếu hơn 11,79 triệu đồng.
Ngoài ra, cơ quan thanh tra còn phát hiện doanh nghiệp xác định chưa đúng một số khoản chi phí được trừ khi tính thuế thu nhập doanh nghiệp.
Cụ thể, tổng số tiền được đưa vào chi phí nhưng không đúng quy định là hơn 377,5 triệu đồng. Trong đó, hơn 259,5 triệu đồng liên quan đến vật tư “dây đồng trần phi 2,6 mm” sử dụng sản xuất dây điện tử nhưng vượt định mức; gần 117,94 triệu đồng là khoản mua ga và bếp ga không phục vụ hoạt động sản xuất, kinh doanh.
Từ việc kê khai chi phí chưa đúng này, số thuế thu nhập doanh nghiệp còn thiếu được xác định hơn 75,5 triệu đồng.
Tổng cộng, Thanh tra tỉnh Hưng Yên yêu cầu Công ty TNHH D&D nộp bổ sung 87.295.555 đồng vào ngân sách nhà nước.
Không chỉ vấn đề về thuế, doanh nghiệp còn được chỉ ra nhiều thiếu sót trong việc thực hiện pháp luật lao động.
Trong đó, công ty chưa sử dụng đúng mẫu báo cáo tình hình tuyển dụng và sử dụng lao động định kỳ; chưa gửi Thỏa ước lao động tập thể đến cơ quan quản lý lao động địa phương theo quy định.
Ở lĩnh vực an toàn, vệ sinh lao động, dù đã xây dựng nội quy và quy trình, doanh nghiệp vẫn chưa niêm yết đầy đủ tại nơi làm việc và khu vực đặt thiết bị. Công ty cũng chưa ban hành quy chế hoạt động của mạng lưới an toàn, vệ sinh viên.
Một vấn đề khác được cơ quan thanh tra nhắc tới là việc khám sức khỏe đối với lao động cao tuổi. Công ty mới tổ chức khám 1 lần/năm, trong khi nhóm lao động này theo quy định phải được khám định kỳ 2 lần/năm.
Thanh tra tỉnh xác định trách nhiệm đối với những tồn tại trên trước hết thuộc về Giám đốc và Ban Giám đốc Công ty TNHH D&D. Kế toán trưởng cùng các cá nhân liên quan cũng chịu trách nhiệm trong phạm vi nhiệm vụ về tài chính, kế toán và thuế.
Theo cơ quan thanh tra, một phần sai sót xuất phát từ việc các quy định pháp luật về lao động thường xuyên thay đổi, doanh nghiệp có thời điểm chưa kịp cập nhật. Tuy nhiên, Công ty TNHH D&D vẫn phải rà soát, khắc phục toàn bộ các tồn tại được chỉ ra và thực hiện đầy đủ nghĩa vụ về thuế, lao động, kế toán và quản lý thuế.